Selbstverständlich wird alles getan, um das Auftreten von Nebenwirkungen und Komplikationen zu vermeiden und die Risiken zu senken. Trotzdem haben alle bisher angeführten Operationen gewisse Risiken. Als wesentliche Risiken sind zu nennen:

• Bei jeder Operation am Auge können Infektionen, Wundheilungsprobleme oder Materialunverträglichkeitsreaktionen auftreten.
• Es besteht die Möglichkeit von Hornhautverkrümmungen.
• Es können Sehverschlechterungen auftreten.
• Der Körper kann nach der Einpflanzung einer Spenderhornhaut Abwehrreaktionen zeigen. Die Folge wäre eine Eintrübung der Hornhaut. Verschiedene Medikamente helfen, eine solche Reaktion zu unterdrücken. Nur im Fall einer anhaltenden Trübung muß eine weitere Transplantation vorgenommen werden.
• Bei einer besonders langen Anwendung kortisonhältiger Medikamente zur Bildung eines Grünen oder Grauen Stars kommen.
• Verletzungen an der Iris oder Linse können nicht ausgeschlossen werden.
• In seltenen Fällen kommt es auch zum Einwachsen von Blutgefäßen, die ihrerseits eine Hornhauttrübung verursachen.